以下はWikipediaより。カッコ内は県別の件数です。
古墳を含んでいたり、古墳時代の遺構でも「○○遺跡」と命名されている場合はリストから抜けてしまっている可能性があります。そもそもWikipediaから目視でまとめたので、網羅性についてはご容赦ください。
いずれも、文化庁のデータベースで調べることができます。
自分がこれまでに訪れたところを一応貼らせていただきました。
・2018/10 一部追記しました。
北海道(1件)
江別(えべつ)古墳群〔江別市〕
青森県(2件)
阿光坊(あこうぼう)古墳群〔上北郡おいらせ町〕
丹後平(たんごたい)古墳群〔八戸市〕
岩手県(2件)
江釣子(えづりこ)古墳群〔北上市〕
角塚(つのづか)古墳 〔奥州市〕
宮城県(4件)
飯野坂(いいのざか)古墳群〔名取市〕
雷神山(らいじんやま)古墳〔名取市〕↓
遠見塚(とおみづか)古墳〔仙台市〕↓
山畑横穴群(やまはたよこあなぐん)〔大崎市〕
秋田県(0件)
山形県(2件)
下小松(しもこまつ)古墳群〔東置賜郡川西町〕
稲荷森(いなりもり)古墳〔南陽市〕
福島県(11件)
大安場(おおやすば)古墳〔郡山市〕↓
泉崎横穴(いずみざきよこあな)〔西白河郡泉崎村〕
白河舟田(しらかわふなだ)・本沼(もとぬま)遺跡群〔白河市〕
桜井(さくらい)古墳〔南相馬市〕
羽山横穴(はやまよこあな)〔南相馬市〕
真野(まの)古墳群〔南相馬市〕
清戸迫横穴(きよとさくよこあな)〔双葉郡双葉町~警戒区域内〕
甲塚(かぶとづか)古墳〔いわき市〕↓
中田横穴(なかたよこあな)〔いわき市〕↓
大塚山(おおつかやま)古墳〔会津若松市〕
亀ヶ森(かみがもり)・鎮守森(ちんじゅもり)古墳〔河沼郡会津坂下町〕
北海道・東北は22件です(その半数が福島県!)
うち、探訪5件、未探訪17件・・・(まだまだです)
次回は関東編です。